Prevalence and antimicrobial susceptibility of non-fermenting Gram-negative bacilli isolated from clinical samples at a tertiary care hospital

Abstract INTRODUCTION: We compared the prevalence and antimicrobial susceptibility of non-fermenting gram-negative bacilli (NFGNB) isolated from clinical samples at a Brazilian tertiary care hospital in 2008 and 2013. METHODS: Collected data included patient's name, age, sex, inpatient unit, laboratory record number, type of biological material, culture test result, and antimicrobial susceptibility of isolated strains. RESULTS: Out of 19,112 culture tests analyzed, 926 (4.8%) were positive for NFGNB. Among these, 45.2% were metallo-beta-lactamase (MBL) producing strains. CONCLUSION: Between 2008 and 2013, the number of MBL-producing NFGNB isolates increased by 21.5%, which was accompanied by a consequent reduction in susceptibility to antimicrobials.

Occurrence and sensitivity profile of extended spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae at a tertiary hospital in Southern Brazil

Abstract: INTRODUCTION: Nosocomial infections are closely associated with antimicrobial drug resistance. One of the most important mechanisms of resistance to β-lactam antibiotics is the production of extended spectrum β-lactamases (ESBLs). The objective of the present study was to evaluate the prevalence and antimicrobial susceptibility profile of ESBL-producing strains and to assess the evolution of antimicrobial drug resistance between 2007 and 2013 at the Hospital São Vicente de Paulo, Passo Fundo, State of Rio Grande do Sul, Brazil. METHODS: We conducted a descriptive, observational, cross-sectional study. Bacterial culture was performed from January to December 2013. The antimicrobial susceptibility profile of these cultures was determined using the disk diffusion method. Phenotypic screening for ESBL production was performed using the disk approximation method. RESULTS : We analyzed a total of 19,112 cultures, 11.5% of which were positive for Enterobacteriaceae. Of these, 30.3% of the isolates were positive for ESBL production, and the most prevalent species was Klebsiella sp. (37.5%). Over 95% of these isolates showed reduced susceptibility to all cephalosporins, aztreonam, and amoxicillin/clavulanic acid. The isolates also showed high sensitivity to the following antimicrobials: amikacin, meropenem, and piperacillin/tazobactam. Overall, the resistance rates among ESBL-producing Enterobacteriaceae decreased from 2007 to 2013. CONCLUSIONS : In our hospital, the increased sensitivity to certain antimicrobial agents seems to be directly related to the implementation of improvements in the methods to prevent and control nosocomial infections in addition to the natural development of other resistance mechanisms.

Molecular characterization of clinical multiresistant isolates of Acinetobacter sp. from hospitals in Porto Alegre, State of Rio Grande do Sul, Brazil / Caracterização molecular de isolados clínicos Acinetobacter sp. multirresistentes em hospitais de Porto Alegre, Estado do Rio Grande do Sul, Brasil

INTRODUCTION: Hospitals around the world have presented multiresistant Acinetobacter sp. outbreaks. The spread of these isolates that harbor an increasing variety of resistance genes makes the treatment of these infections and their control within the hospital environment more difficult. This study aimed to evaluate the occurrence and dissemination of Acinetobacter sp. multiresistant isolates and to identify acquired resistance genes. METHODS: We analyzed 274 clinical isolates of Acinetobacter sp. from five hospitals in Porto Alegre, RS, Brazil. We evaluated the susceptibility to antimicrobial, acquired resistance genes from Ambler's classes B and D, and performed molecular typing of the isolates using enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction (ERIC-PCR) technique. RESULTS: A high (68 percent) percentage of multiresistant isolates of Acinetobacter sp. was observed, and 69 percent were resistant to carbapenems. We identified 84 percent of isolates belonging to species A. baumannii because they presented the gene blaOXA-51. The gene blaOXA-23 was detected in 62 percent of the isolates, and among these, 98 percent were resistant to carbapenems. Using the ERIC-PCR technique, we identified clones of Acinetobacter sp. spread among the four hospitals analyzed during the sampling period. CONCLUSIONS: The data indicate the dissemination of Acinetobacter sp. isolates among hospitals and their permanence in the hospital after one year.

INTRODUÇÃO: Hospitais no mundo todo têm apresentado surtos de Acinetobacter sp. multirresistentes. A disseminação destes isolados com uma variedade cada vez maior de genes de resistência torna difícil o tratamento destas infecções e seu controle dentro do ambiente hospitalar. Este trabalho teve como objetivo avaliar a ocorrência e disseminação de isolados de Acinetobacter sp. multirresistentes e identificar genes de resistência adquirida. MÉTODOS: Foram avaliados 274 isolados clínicos de Acinetobacter sp. obtidos de cinco hospitais da Cidade de Porto Alegre, RS, Brasil. Avaliamos o perfil de suscetibilidade a antimicrobianos, genes de resistência adquirida das classes B e D de Ambler e realizamos a tipificação molecular dos isolados utilizando a técnica de enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction (ERIC-PCR). RESULTADOS: Encontramos uma alta (68 por cento) porcentagem de isolados de Acinetobacter sp. multirresistentes e 69 por cento dos isolados apresentaram resistência aos carbapenêmicos. Foram identificados 84 por cento de isolados pertencentes a espécie A. baumannii, pois apresentaram o gene blaOXA-51. Em 62 por cento dos isolados, foi detectado o gene blaOXA-23, sendo que 98 por cento destes isolados foram resistentes aos carbapenêmicos. Através da tipificação molecular pela técnica de ERIC-PCR identificamos clones de Acinetobacter sp. disseminados entre quatro dos hospitais analisados e nos anos de 2006 e 2007. CONCLUSÕES: Os dados obtidos indicam a disseminação de isolados de Acinetobacter sp. entre hospitais assim como sua permanência no ambiente hospitalar após um ano.

Occurrence and the susceptibility to antimicrobial agents in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter sp. at a tertiary hospital in southern Brazil / Ocorrência e perfil de sensibilidade a antimicrobianos em Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter sp. em um hospital terciário, no sul do Brasil

INTRODUCTION: The main mechanism of emerging resistance in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter sp. isolates is the production of metallo-β-lactamases (MβLs). MβLs are enzymes capable of hydrolyzing cephalosporins, penicillins and carbapenems, but not monobactams (aztreonam), which are often used as antimicrobial therapy to treat nosocomial infections. METHODS: An observational descriptive and retrospective study was designed to assess the frequency of MβLs among strains of P. aeruginosa and Acinetobacter sp. obtained from a tertiary hospital in southern Brazil. RESULTS: MβL production was observed in 77.6 percent (n = 173/223) for P. aeruginosa isolates and 22.4 percent (n = 50/223) of Acinetobacter sp. isolates. The Acinetobacter sp. isolates showed 92.8 percent sensitivity to amikacin and P. aeruginosa isolates showed 58.9 percent sensitivity to aztreonam. CONCLUSIONS: The MβL indices determined confirm the global concern with this mechanism of resistance.

INTRODUÇÃO: O principal mecanismo de resistência entre isolados de Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter sp. é a produção de metalo-β-lactamases (MβLs). As MβLs são enzimas capazes de hidrolisar cefalosporinas, penicilinas e carbapenêmicos, mas não monobactâmicos (aztreonam) antibióticos que se encontram entre as principais opções terapêuticas para o tratamento de infecções causadas por bactérias não fermentadoras de glicose. MÉTODOS: Um estudo observacional, transversal, descritivo e retrospectivo foi desenvolvido para avaliar a frequência e o perfil de susceptibilidade cepas de P. aeruginosa e Acinetobacter sp. produtoras de MβLs isoladas no Hospital São Vicente de Paulo, Passo Fundo, Brasil. RESULTADOS: A produção de MβLs foi observada em 77,6 por cento (n = 173/223) dos isolados de P. aeruginosa e em 22,4 por cento (n = 50/223) dos isolados de Acinetobacter sp. Dentre as cepas produtoras de MβL, a maioria apresentou mais de 90 por cento de resistência a seis antimicrobianos dos 12 testados, enfatizando a resistência a ceftazidima, gentamicina, aztreonam, piperaciclina/tazobactam, cefepime, ciprofloxacina, meropenem e tobramicina. CONCLUSÕES: Os índices de MβL encontrados confirmam a preocupação mundial com a disseminação desse mecanismo de resistência.

Enterobactérias produtoras de ESBL em Passo Fundo, estado do Rio Grande do Sul, Brasil / ESBL-producing enterobacteria in Passo Fundo, state of Rio Grande do Sul, Brazil

INTRODUÇÃO: O principal mecanismo de resistência emergente entre Enterobacteriaceae é a produção de β-lactamases de espectro estendido, enzimas capazes de hidrolisar cefalosporinas-de-amplo-espectro, que são bastante utilizadas na terapia antimicrobiana de infecções por enterobactérias. Embora a resistência a esses agentes apresente grande variabilidade geográfica, os índices de resistência são elevados em diversos países MÉTODOS: Um estudo observacional, transversal, descritivo e retrospectivo foi desenvolvido para avaliar a frequência de ESBL entre cepas de Enterobacteriaceae obtidas no Hospital São Vicente de Paulo, Brasil RESULTADOS: A produção de ESBL foi observada em 24,8 por cento (nº=208/838) dos isolados avaliados. Isolados de Escherichia coli representaram 46,2 por cento (nº=96/208) do percentual de produtores de ESBL, seguido de espécies de Enterobacter 30,3 por cento (nº=63/208). A sensibilidade desses isolados ao meropenem foi de 91,4 por cento e a piperacilina/tazobactam de 67,4 por cento CONCLUSÕES: Os índices de ESBL encontrados confirmam a preocupação mundial com este mecanismo de resistência.

INTRODUCTION: The main emerging resistance mechanism relating to Enterobacteriaceae is represented by production of extended spectrum β-lactamases (ESBLs). These enzymes have the capacity to hydrolyze broad-spectrum cephalosporins and are greatly used for antimicrobial chemotherapy on enterobacterial infections. Although resistance to these agents presents remarkable geographical variability, the resistance rates are high in many countries METHODS: A retrospective observational cross-sectional descriptive study was developed to evaluate the frequency of ESBLs among Enterobacteriaceae strains obtained from Hospital São Vicente de Paulo, Brazil RESULTS: ESBL production was noted in 24.8 percent (n = 208/838) of the isolates evaluated. Isolates of Escherichia coli represented 46.2 percent (n = 96/208) of the ESBL producers, followed by Enterobacter species (30.3 percent; n = 63/208). The sensitivity of these isolates to meropenem was 91.4 percent and to piperacillin/tazobactam, 67.4 percent CONCLUSIONS: The ESBL levels founded confirm the worldwide concern regarding this resistance mechanism.

Resistência a β-lactâmicos em Acinetobacter spp isolados de efluente hospitalar no sul do Brasil / Resistance to β-lactams among Acinetobacter spp isolated from hospital sewage in southern Brazil

Acinetobacter spp é um importante patógeno causador de infecções nosocomiais que acomete pacientes imunocomprometidos e capaz de adquirir resistência a antimicrobianos com facilidade. Os esgotos hospitalares são importantes disseminadores de genes de resistência a antimicrobianos para a microbiota ambiental. Neste contexto, 30 cepas de Acinetobacter spp provenientes de efluente de um hospital em Porto Alegre, RS, foram analisados quanto ao perfil de susceptibilidade a β-lactamases, quinolonas e aminoglicosídeos através de antibiograma e testes de triagem para metalo beta-lactamases e β-lactamases de espectro estendido. O perfil encontrado revela cepas multi-resistentes e que mecanismos de resistência como a produção de β-lactamases de espectro estendido e bombas de efluxo podem estar presentes nesses isolados.

Acinetobacter spp is an important pathogen that is responsible for nosocomial infections affecting immunocompromised patients, and it can easily acquire resistance to antimicrobial agents. Hospital sewage is an important means for disseminating genes for resistance to antimicrobial agents, to the microbiota of the environment. Within this context, 30 strains of Acinetobacter spp from the sewage of a hospital in Porto Alegre, Rio Grande do Sul, were analyzed regarding their profile of susceptibility to β-lactams, quinolones and aminoglycosides, by means of an antibiogram and tests to screen for metallo-β-lactamases and extended-spectrum β-lactamases. The profile obtained revealed the presence of multidrug-resistant strains and showed that resistance mechanisms such as the production of extended-spectrum β-lactamases and efflux pumps may be present in these strains.

Disseminação de Metalo-ß-Lactamases: triagem revela a presença do gene BLA SPM-1 em efluente hospitalar no Sul do Brasil / Spread of Metalo-ß-Lactamases: screening reveals the presence of a BLA SPM-1 gene in hospital sewage in southern Brazil

Of 396 Pseudomonas aeruginosa strains isolated from hospital sewage, the blaSPM-1 gene was confirmed in nine. This is the first report of environmental P. aeruginosa strains carrying the blaSPM-1 gene in Brazil. The carbapenem resistance, already disseminated among clinical isolates, has been detected among environmental isolates.

Ao todo, 396 isolados de Pseudomonas aeruginosa foram estudados. O gene blaSPM-1 foi encontrado em nove isolados de efluente hospitalar. Este estudo é o primeiro relato de isolados ambientais de P. aeruginosa com o gene blaSPM-1no Brasil. A resistência aos carbapenêmicos, amplamente disseminada entre isolados clínicos, já é detectada em isolados ambientais.

Pseudomonas aeruginosa: disseminação de resistência antimicrobiana em efluente hospitalar e água superficial / Pseudomonas aeruginosa: spread of antimicrobial resistance in hospital effluent and surface water

O objetivo deste estudo foi comparar amostras de efluente do Hospital São Vicente de Paulo com amostras de água do Rio Passo Fundo, quanto ao perfil de susceptibilidade de isolados de Pseudomonas aeruginosa, para inferir sobre a presença de isolados de origem hospitalar em amostras de água superficial. A significância estatística entre os perfis de susceptibilidade das amostras foi testada por análise de variância e a comparação das amostras foi feita por contrastes de interesse. Foram identificados 198 isolados de Pseudomonas aeruginosa a partir das amostras analisadas. O fenótipo de multirresistência não foi observado nas amostras do Rio Passo Fundo, embora alguns isolados resistentes a carbapenêmicos tenham sido identificados, indicando a presença de contaminação com bactérias provenientes de um ambiente sob forte pressão seletiva. Diferenças significativas entre as amostras de água e efluente hospitalar foram observadas a partir da análise de variância por contrastes de interesse.

The aim of this study was to compare sewage samples from Hospital São Vicente de Paulo with water samples from the Passo Fundo river, with regard to the susceptibility profile of Pseudomonas aeruginosa isolates, in order to make inferences about the presence of strains of hospital origin in surface water samples. The statistical significance between the susceptibility profiles of the samples was tested using analysis of variance, and the samples were compared by means of contrasts of interest. One hundred and ninety-eight isolates of Pseudomonas aeruginosa were recovered from the samples analyzed. No phenotype for multiresistance was found in the samples from the Passo Fundo river, although some carbapenem-resistant isolates were identified, thereby indicating the presence of contamination with bacteria derived from an environment under strong selection pressure. Significant differences between the water and hospital effluent samples were observed, based on the analysis of variance by means of contrasts of interest.

Ocorrência de cepas de Pseudomonas aeruginosa multirresistentes produtoras de metalo-beta-lactamase blaSPM-1 em amostras clínicas / Occurrence of multiresistant strains of Pseudomonas aeruginosa producing metallo-beta-lactamase blaSPM-1 in clinical samples

Este estudo avaliou a ocorrência de genes para metalo β-lactamases em isolados clínicos de Pseudomonas aeruginosa do Hospital São Vicente de Paulo, RS. Os genes foram pesquisados por PCR e o perfil de susceptibilidade foi avaliado por disco-difusão. Foram analisadas 46 cepas, sendo que cinco apresentaram o gene blaSPM-1.

This study analyzed the occurrence of metallo-β-lactamase genes in clinical samples of Pseudomonas aeruginosa from the Hospital São Vicente de Paulo, RS. The genes were analysed by PCR and the susceptibility profiles were studied by diffusion-disk. Forty six strains were analyzed and five strains were positive for blaSPM-1 gene.

Characterization of enterocins produced by Enterococcus mundtii isolated from humans feces

The aim of this study was to characterize bacteriocins produced by 70 strains of Enterococcus mundtii.Four strains exhibited antibiotic activity towards Listeria innocua, L. monocytogenes, Lactobacillus plantarum, and Salmonella Enteritidis. They remained active under temperatures of up to 121°C for 20 min, and under pH treatments that varied from 2.0 to 10.0. Antimicrobial activity was maintained during the storage test for 60 days under freezing. The kinetics of production revealed the peak activity of 1600 AU /mL during the logarithmic growth phase and the molecular weight found was approximately 3.0 kDa. The characterization of the products with antimicrobial activity indicated their proteic nature, presenting a typical kinetics of primary metabolite and a molecular weight similar to many purified enterocins.

O objetivo do presente estudo foi caracterizar bacteriocinas produzidas por 70 cepas de Enterococcus mundtii. Estas foram caracterizadas quanto a sua atividade antimicrobiana, sensibilidade ao aquecimento, pH, armazenamento e enzimas proteolíticas. Foi também determinada sua cinética de produção e peso molecular. Entre as 70 cepas analisadas, quatro apresentaram atividade antibiótica contra Listeria innocua, L. monocytogenes, Lactobacillus plantarum, e Salmonella Enteritidis. Esta atividade foi mantida em temperaturas até 121°C por 20 minutos, e sob condições de pH entre 2,0 e 10,0. A atividade antimicrobiana foi mantida nos testes de armazenamento a -20°C, por 60 dias. A cinética de produção revelou picos de atividade de 1600 AU/mL durante a fase logarítmica de crescimento e o peso molecular foi de aproximadamente 3,0 kDa. A caracterização dos produtos com atividade antimicrobiana revelaram suas naturezas protéicas, cinéticas de metabólito primário e peso molecular semelhante aos das enterocinas já purificadas.